EcoGenesis · Энциклопедия

Библиотека живого мира

Организмы, строение, процессы и учебные маршруты. Читайте объяснения и переходите к связанным данным и источникам.

8 материалов

Типы и алфавит · Руководства

Г

Руководства

Ген, транскрипт и белок: как связаны записи

Одна молекулярная история может быть представлена несколькими записями. Ген описывают на геномной последовательности; транскрипт представляет РНК-продукт, а белковая запись — аминокислотную последовательность. RefSeq хранит геномные, транскриптные и белковые последовательности как разные связанные объекты. Начните с вопроса, что именно открыто перед вами.

Редакционный материал · ожидает рецензирования

К

Руководства

Как сравнивать ели по признакам и геномным данным

Сравнение начинается с идентичности. Откройте *Picea abies* и *Picea glauca*, проверьте научные названия, источник и ранг. Если другой справочник использует иное принятое имя, сохраните его трактовку отдельно вместе со ссылкой. Похожее русское название или общий род ещё не делают две записи взаимозаменяемыми.

Редакционный материал · ожидает рецензирования

Руководства

Как читать биологическую классификацию

Классификация помогает понять, к какой группе относится организм и какие группы входят в неё. Вид, род и семейство — названия рангов; самими группами, или таксонами, будут, например, *Arabidopsis thaliana*, *Arabidopsis* и Brassicaceae. Ранг отвечает на вопрос об уровне в системе, а название — о выбранном объекте. Читая карточку, сначала найдите научное имя, ранг и источник…

Редакционный материал · ожидает рецензирования

Руководства

Как читать структуру белка и оценивать предсказание

Перед вращением модели выясните, что она представляет. Экспериментальная структура основана на измерениях; вычислительная модель предсказывает расположение атомов. Для первой важны метод и показатели качества соответствующего эксперимента, для второй — метод моделирования и оценки уверенности. RCSB показывает эти сведения раздельно. Красивое трёхмерное изображение не заменяет…

Редакционный материал · ожидает рецензирования

О

Руководства

Ортологи, паралоги и семейства генов

Поиск по имени помогает найти запись, но сам по себе не устанавливает эволюционную связь. Гомология означает общее происхождение. Ортологи разошлись при видообразовании, паралоги — при дупликации гена. Ортология бывает не только «один к одному», но и «один ко многим» или «многие ко многим». Поэтому одного факта «эти гены находятся в разных видах» недостаточно для определения…

Редакционный материал · ожидает рецензирования

П

Руководства

Почему Arabidopsis используют в исследованиях развития

*Arabidopsis thaliana* позволяет связывать наблюдаемое развитие растения с генами и их работой. Роль модельного организма определяется также накопленными данными и возможностью сопоставлять исследования. Публикация генома в 2000 году стала важной основой для изучения функций генов. Числа из той работы относятся к её исторической сборке и аннотации, а не автоматически к…

Редакционный материал · ожидает рецензирования

Ч

Руководства

Чем классификация отличается от эволюционного дерева

Ветка классификации сообщает, куда источник поместил таксон. Филогенетическое дерево представляет гипотезу о родственных отношениях исследованных линий. Эти представления связаны, но одинаковый способ рисования не делает их одинаковыми данными. В начале работы прочитайте название слоя: классификация, филогения видов или дерево семейства генов.

Редакционный материал · ожидает рецензирования

Руководства

Что показывает карта наблюдений GBIF

Карта находок GBIF показывает опубликованные записи об организмах: например, музейные образцы и полевые наблюдения. Точка означает, что источник сообщил об организме в определённом месте и времени; она не подсчитывает всех особей там. Сначала проверьте, какой вид, территорию, даты и типы записей включает запрос.

Редакционный материал · ожидает рецензирования