Доступно в указанной областиCatalogue of Life
Закреплённые названия и классификация
- Поиск названий
- Просмотр точных групп
- Чтение классификации
Запись названия не означает готовую статью, молекулярное соответствие или филогенетическое дерево.
Права и область данных
Сохранение выпуска, исходных идентификаторов и атрибуции
организм или группа
Ограниченная областьGBIF
Организмы и опубликованные наблюдения
- Определение точной идентичности
- Чтение ограниченной выборки наблюдений
- Чтение метаданных набора
Наблюдения не описывают полный ареал; чувствительные координаты и изображения без допустимых прав закрыты.
Права и область данных
Лицензии наборов данных и изображений проверяются отдельно
организм или группа, наблюдение, набор данных, изображение
Ограниченная областьWikimedia Commons
Фотографии и иллюстрации с атрибуцией
- Чтение метаданных изображений с допустимой лицензией
Совпадение названия не подтверждает организм на фотографии; идентичность проверяется отдельно.
Права и область данных
Только допустимые лицензии с указанием автора и источника
изображение
Ограниченная областьNCBI Taxonomy
Идентификаторы организмов в источнике
- Чтение идентичности организма
- Чтение классификации источника
Конфликты источников остаются явными; понятия NCBI и CoL не объединяются автоматически.
Права и область данных
Сохранение происхождения записи
организм или группа
Ограниченная областьNCBI Datasets / Nucleotide
Версионные сборки и ограниченные участки ДНК
- Чтение метаданных сборки
- Чтение компонентов
- Чтение ограниченного участка последовательности
Доступность сборок различается. Массовая загрузка геномов не входит в эту публичную операцию.
Права и область данных
Сохранение идентификатора, версии и условий источника
сборка, последовательность
Ограниченная областьNCBI Gene
Гены и перекрёстные ссылки
- Чтение точной записи гена
- Каталог генов выбранного организма
Ссылка источника не доказывает взаимозаменяемость сборок или транскриптов.
Права и область данных
Сохранение версии и атрибуции
ген
Ограниченная областьUniProtKB
Последовательности белков и аннотации
- Поиск белков
- Чтение точной записи белка
- Чтение аннотаций источника
Аннотация не является измерением образца; коды доказательств и оговорки сохраняются.
Права и область данных
Сохранение лицензии, атрибуции и версий записи и последовательности
белок, организм или группа
Ограниченная областьInterPro
Домены выбранного белка
- Домены по идентификатору белка
Совпадение домена не устанавливает полный биологический механизм.
Права и область данных
Сохранение атрибуции базы данных
белок, домен, семейство
Ограниченная областьEnsembl
Гены, гомология и деревья с указанием вида
- Точный ген и его транскрипты
- Гомология по данным поставщика
- Чтение дерева генов
Нужны вид и стабильный ID. Сохранённые деревья подписаны; сходство не переименовывается в ортологию.
Права и область данных
Сохранение выпуска, сборки и утверждений поставщика
ген, транскрипт, дерево генов
Ограниченная областьGene Ontology / QuickGO
GO-аннотации с доказательствами
Отрицание, экспериментальные и косвенные основания остаются раздельными.
Права и область данных
Сохранение кодов, ссылок, назначившего аннотацию источника и лицензии
белок, термин онтологии
Ограниченная областьEurope PMC
Литература, связанная с объектом
- Ограниченный поиск библиографических метаданных
Упоминание названия или цитата не подтверждают утверждение. Полные тексты не перепубликуются автоматически.
Права и область данных
Права на метаданные и полный текст проверяются отдельно
статья
Ограниченная областьCrossref
DOI и точные упоминания названий
- Ограниченное чтение метаданных DOI
Совпадения показаны как упоминания. Общее разрешение реестра не меняется.
Права и область данных
Только разрешённая ограниченная выборка метаданных; без общего разрешения на перепубликацию аннотаций и полного текста
статья
Не подключено к этому публичному путиOpenAlex
Адаптер научных метаданных
Публичные операции не заявлены.
Публичная библиография использует Europe PMC и разрешённые метаданные Crossref. Наличие адаптера не означает живое покрытие.
Права и область данных
Нужна проверка условий конкретной операции
статья
Ограниченная областьEuropean Nucleotide Archive
Опубликованные образцы, исследования и идентификаторы
- Чтение опубликованных образцов
- Чтение метаданных исследования
- Чтение перекрёстных ссылок идентификаторов
Запись образца не означает анализ, точное место сбора или согласованную каноническую таксономию.
Права и область данных
Сохранение подтверждения получения и условий конкретной операции
образец, исследование, последовательность
Ограниченная областьBioSamples
Публичные метаданные образцов
- Чтение публичных метаданных образца
Неизвестные методы, единицы и условия остаются неизвестными; связи требуют прямого основания в источнике.
Права и область данных
Сохранение происхождения и ограничений доступа
образец, исследование
Не подключено к этому публичному путиBOLD Systems
Возможный источник штрихкодов
Публичные операции не заявлены.
Не входит в этот публичный путь. Доступность ENA не означает доступность BOLD.
Права и область данных
Нужна отдельная проверка лицензии адаптера
последовательность, образец
Ограниченная областьiNaturalist
Опубликованные наблюдения и фотографии
- Чтение ограниченной выборки наблюдений
- Чтение метаданных фото с допустимыми правами
Research-grade — обозначение поставщика; идентичность и права на фото проверяются отдельно.
Права и область данных
Лицензии записей и фотографий проверяются независимо
организм или группа, наблюдение, изображение
Ограниченная областьGlobal Biotic Interactions
Сообщения о взаимодействиях организмов
- Чтение опубликованных взаимодействий
Это утверждения источников, а не измерения изображённого образца.
Права и область данных
Сохранение цитирования и происхождения взаимодействия
организм или группа, взаимодействие
Ограниченная областьWikidata
Внешние идентификаторы и контекст
- Чтение внешних идентификаторов источника
Внешний ID не заменяет принятую таксономию и не разрешает конфликт автоматически.
Права и область данных
Сохранение утверждений источника
организм или группа
Ограниченная областьWikipedia / MediaWiki
Объяснения из закреплённых редакций
- Чтение допущенных описаний
Описание не меняет таксономию, допуск публикации или идентичность источника.
Права и область данных
Лицензированный текст на указанном языке с атрибуцией
статья, организм или группа
Ограниченная областьPDB
Подготовленные экспериментальные структуры
- Чтение подготовленных структур
Покрытие ограничено; метод эксперимента и исходная запись сохраняются.
Права и область данных
Сохранение условий источника и экспериментального происхождения
белок, структура
Ограниченная областьAlphaFold DB
Подготовленные предсказанные структуры
- Чтение подготовленных моделей
Уверенность предсказания не является экспериментальной проверкой.
Права и область данных
Сохранение условий источника и происхождения модели
белок, структура
Не подключено к этому публичному путиOpen Tree of Life
Адаптер синтетической топологии
Публичные операции не заявлены.
Просмотр классификации не означает допуск публичной синтетической филогении.
Права и область данных
Публичное использование зависит от решения об условиях в реестре
организм или группа, дерево