← Вернуться к чтению

· Объяснение по указанным источникам

DnaA · P03004

Войти и сохранить
На этой странице

Знакомство с белком

DnaA — белковая запись P03004 из UniProt для Escherichia coli (strain K12) (NCBI 83333). В сохранённой версии последовательность содержит 467 аминокислот.

[1]
Основание утверждения

Аннотация источника

Что известно о функции

Функция: текст и доказательства UniProt (EN)

Посмотреть структурированные данные
source text
Plays an essential in the initiation and regulation of chromosomal replication. Binds in an ATP-dependent fashion to the origin of replication (oriC) to initiate formation of the DNA replication initiation complex once per cell cycle (PubMed:3036372). Binds the DnaA box (consensus sequence 5'-TTATC[CA]A[CA]A-3') and separates the double-stranded (ds)DNA (PubMed:3036372, PubMed:18216012). Forms a right-handed helical filament on oriC DNA; dsDNA binds to the exterior of the filament while single-stranded (ss)DNA is stabiized in the filament's interior (By similarity). The ATP-DnaA-oriC complex binds and stabilizes the upper strand of the AT-rich DNA unwinding element (DUE) (PubMed:18216012). Mutagenesis of residues that line the central pore blocks dsDNA strand separation (PubMed:18216012). Subsequent binding of DNA polymerase III subunits leads to replisome formation (PubMed:3036372, PubMed:18216012). The DnaA-ATP form converts to DnaA-ADP; once converted to ADP the protein cannot initiate replication, ensuring only 1 round of replication per cell cycle (PubMed:3036372). Binds ATP, ADP and dATP equally well, hydrolyzes ATP with a half-life of about 15 minutes, ATP hydrolysis is not required for pre-priming replisome formation, nucleotide exchange is very slow (PubMed:3036372). Binds acidic phospholipids (PubMed:9478970, PubMed:26272946). DnaA inhibits its own gene expression (PubMed:2981626) as well as that of other genes including dam, rpoH (PubMed:2540187), ftsA and mioC
source language
en
evidence codes
  • evidenceCode
    ECO:0000250
    source
    UniProtKB
    id
    O66659
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    18216012
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    2540187
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    26272946
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    2981626
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    3036372
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    9478970
[1]
Основание утверждения

Аннотация источника

Код доказательства относится к аннотации. Запись не является измерением изображённого организма.

Функция: текст и доказательства UniProt (EN)

Посмотреть структурированные данные
source text
Also required for replication of some plasmid DNA; binds 4 DnaA boxes in the minimal plasmid RK2 replication origin (oriV)
source language
en
evidence codes
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    15878847
  • evidenceCode
    ECO:0000269
    source
    PubMed
    id
    9242693
[1]
Основание утверждения

Аннотация источника

Код доказательства относится к аннотации. Запись не является измерением изображённого организма.

Последовательность и версия

P03004

Посмотреть структурированные данные
accession
P03004
name
Chromosomal replication initiator protein DnaA
length
467
entry version
211
sequence version
2
sequence
MSLSLWQQCLARLQDELPATEFSMWIRPLQAELSDNTLALYAPNRFVLDWVRDKYLNNIN
GLLTSFCGADAPQLRFEVGTKPVTQTPQAAVTSNVAAPAQVAQTQPQRAAPSTRSGWDNV
PAPAEPTYRSNVNVKHTFDNFVEGKSNQLARAAARQVADNPGGAYNPLFLYGGTGLGKTH
LLHAVGNGIMARKPNAKVVYMHSERFVQDMVKALQNNAIEEFKRYYRSVDALLIDDIQFF
ANKERSQEEFFHTFNALLEGNQQIILTSDRYPKEINGVEDRLKSRFGWGLTVAIEPPELE
TRVAILMKKADENDIRLPGEVAFFIAKRLRSNVRELEGALNRVIANANFTGRAITIDFVR
EALRDLLALQEKLVTIDNIQKTVAEYYKIKVADLLSKRRSRSVARPRQMAMALAKELTNH
SLPEIGDAFGGRDHTTVLHACRKIEQLREESHDIKEDFSNLIRTLSS
[1]
Основание утверждения

Аннотация источника

Гены и домены

Связи, указанные UniProt

Посмотреть структурированные данные
gene symbols
  • dnaA
gene crossreferences
  • database
    GeneID
    id
    93778443
    properties
    • key
      Description
      value
      -
  • database
    GeneID
    id
    948217
    properties
    • key
      Description
      value
      -
interpro domains
  • provider
    interpro
    accession
    IPR003593
    name
    AAA+_ATPase
  • provider
    interpro
    accession
    IPR001957
    name
    Chromosome_initiator_DnaA
  • provider
    interpro
    accession
    IPR020591
    name
    Chromosome_initiator_DnaA-like
  • provider
    interpro
    accession
    IPR018312
    name
    Chromosome_initiator_DnaA_CS
  • provider
    interpro
    accession
    IPR013159
    name
    DnaA_C
  • provider
    interpro
    accession
    IPR013317
    name
    DnaA_dom
  • provider
    interpro
    accession
    IPR024633
    name
    DnaA_N_dom
  • provider
    interpro
    accession
    IPR038454
    name
    DnaA_N_sf
  • provider
    interpro
    accession
    IPR027417
    name
    P-loop_NTPase
  • provider
    interpro
    accession
    IPR010921
    name
    Trp_repressor/repl_initiator
[1]
Основание утверждения

Аннотация источника

Ссылка базы данных не заменяет проверку сборки и штамма. P03004 относится к K12 (83333); старый профиль гена относится к MG1655 (511145). Эти таксоны не объединены.

Аннотации функций GO

Выборка с кодами доказательств

Посмотреть структурированные данные

Показано / подготовлено / в ответе источника: 12 / 54 / 54

GO
GOДоказательствоПубликация или правилоКто аннотировал
GO:0006260
DNA replication
Biological Process		ECO:0000315
acts_upstream_of_or_within		PMID:12068813EcoliWiki
20100503
GO:0006275
regulation of DNA replication
Biological Process		ECO:0000315
acts_upstream_of_or_within		PMID:12068813EcoliWiki
20100503
GO:0003677
DNA binding
Molecular Function		ECO:0000256
enables		GO_REF:0000002InterPro
20260727
GO:0003677
DNA binding
Molecular Function		ECO:0000314
enables		PMID:7615570EcoCyc
20110629
GO:0003688
DNA replication origin binding
Molecular Function		ECO:0000318
enables		GO_REF:0000033GO_Central
20260424
GO:0003688
DNA replication origin binding
Molecular Function		ECO:0000501
enables		GO_REF:0000120UniProt
20260727
GO:0003688
DNA replication origin binding
Molecular Function		ECO:0000315
enables		PMID:19833870EcoCyc
20110629
GO:0005515
protein binding
Molecular Function		ECO:0000353
enables		PMID:10972842IntAct
20260725
GO:0005515
protein binding
Molecular Function		ECO:0000353
enables		PMID:15690043IntAct
20260725
GO:0005515
protein binding
Molecular Function		ECO:0000353
enables		PMID:15690043IntAct
20260725
GO:0005515
protein binding
Molecular Function		ECO:0000353
enables		PMID:17699754IntAct
20260725
GO:0005515
protein binding
Molecular Function		ECO:0000353
enables		PMID:18179598IntAct
20260725
[2]
Основание утверждения

Аннотация источника

Это аннотации источника, а не самостоятельное доказательство причинного механизма. Полный сохранённый ответ доступен в оригиналах.

Исследования из записи белка

Библиографические записи

Посмотреть структурированные данные
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-6296774
    title
    The nucleotide sequence of the dnaA gene and the first part of the dnaN gene of Escherichia coli K-12.
    pmid
    6296774
    doi
    10.1093/nar/10.22.7373
    year
    1982
    authors
    • Hansen E.B.
    • Hansen F.G.
    • von Meyenburg K.
    journal
    Nucleic Acids Res.
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-6234204
    title
    Structural analysis of the dnaA and dnaN genes of Escherichia coli.
    pmid
    6234204
    doi
    10.1016/0378-1119(84)90253-1
    year
    1984
    authors
    • Ohmori H.
    • Kimura M.
    • Nagata T.
    • Sakakibara Y.
    journal
    Gene
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-7686882
    title
    DNA sequence and analysis of 136 kilobases of the Escherichia coli genome: organizational symmetry around the origin of replication.
    pmid
    7686882
    doi
    10.1006/geno.1993.1230
    year
    1993
    authors
    • Burland V.D.
    • Plunkett G. III
    • Daniels D.L.
    • Blattner F.R.
    journal
    Genomics
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-9278503
    title
    The complete genome sequence of Escherichia coli K-12.
    pmid
    9278503
    doi
    10.1126/science.277.5331.1453
    year
    1997
    authors
    • Blattner F.R.
    • Plunkett G. III
    • Bloch C.A.
    • Perna N.T.
    • Burland V.
    • Riley M.
    • Collado-Vides J.
    • Glasner J.D.
    • Rode C.K.
    • Mayhew G.F.
    • Gregor J.
    • Davis N.W.
    • Kirkpatrick H.A.
    • Goeden M.A.
    • Rose D.J.
    • Mau B.
    • Shao Y.
    journal
    Science
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-16738553
    title
    Highly accurate genome sequences of Escherichia coli K-12 strains MG1655 and W3110.
    pmid
    16738553
    doi
    10.1038/msb4100049
    year
    2006
    authors
    • Hayashi K.
    • Morooka N.
    • Yamamoto Y.
    • Fujita K.
    • Isono K.
    • Choi S.
    • Ohtsubo E.
    • Baba T.
    • Wanner B.L.
    • Mori H.
    • Horiuchi T.
    journal
    Mol. Syst. Biol.
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-6329723
    title
    The nucleotide sequence of the dnaA gene promoter and of the adjacent rpmH gene, coding for the ribosomal protein L34, of Escherichia coli.
    pmid
    6329723
    doi
    10.1002/j.1460-2075.1982.tb01294.x
    year
    1982
    authors
    • Hansen F.G.
    • Hansen E.B.
    • Atlung T.
    journal
    EMBO J.
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-2981626
    title
    Autoregulation of the DNA replication gene dnaA in E. coli K-12.
    pmid
    2981626
    doi
    10.1016/0092-8674(85)90319-8
    year
    1985
    authors
    • Braun R.E.
    • O'Day K.
    • Wright A.
    journal
    Cell
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-3036372
    title
    ATP activates dnaA protein in initiating replication of plasmids bearing the origin of the E. coli chromosome.
    pmid
    3036372
    doi
    10.1016/0092-8674(87)90221-2
    year
    1987
    authors
    • Sekimizu K.
    • Bramhill D.
    • Kornberg A.
    journal
    Cell
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-2540187
    title
    dnaA protein regulates transcriptions of the rpoH gene of Escherichia coli.
    pmid
    2540187
    doi
    10.1016/s0021-9258(18)83238-0
    year
    1989
    authors
    • Wang Q.P.
    • Kaguni J.M.
    journal
    J. Biol. Chem.
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-9478970
    title
    Membrane-mediated release of nucleotide from an initiator of chromosomal replication, Escherichia coli DnaA, occurs with insertion of a distinct region of the protein into the lipid bilayer.
    pmid
    9478970
    doi
    10.1074/jbc.273.9.5167
    year
    1998
    authors
    • Garner J.
    • Durrer P.
    • Kitchen J.
    • Brunner J.
    • Crooke E.
    journal
    J. Biol. Chem.
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-9674428
    title
    The initiator function of DnaA protein is negatively regulated by the sliding clamp of the E. coli chromosomal replicase.
    pmid
    9674428
    doi
    10.1016/s0092-8674(00)81222-2
    year
    1998
    authors
    • Katayama T.
    • Kubota T.
    • Kurokawa K.
    • Crooke E.
    • Sekimizu K.
    journal
    Cell
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
  • source
    uniprot
    id
    P03004-citation-9298644
    title
    Escherichia coli proteome analysis using the gene-protein database.
    pmid
    9298644
    doi
    10.1002/elps.1150180805
    year
    1997
    authors
    • VanBogelen R.A.
    • Abshire K.Z.
    • Moldover B.
    • Olson E.R.
    • Neidhardt F.C.
    journal
    Electrophoresis
    rights reuse state
    metadata_only
    source url
    https://rest.uniprot.org/uniprotkb/P03004.json
    source snapshot sha256
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
[1]
Основание утверждения

Аннотация источника

Показаны метаданные. Право на текст статьи определяется отдельно.

Организм записи UniProt

Escherichia coli (strain K12) · NCBI 83333Научный профиль →

Ваш исследовательский вопрос

Сохраните статью, чтобы вернуться к вопросу и этой версии источников.

Продумать проверку

Это ваш план исследования. Заполнение полей не подтверждает гипотезу.

Источники и версии

Объяснение по указанным источникам

  1. UniProt Consortium · P03004

    2026-09-09T03:19:40.940804+00:00 · CC-BY-4.0

    Происхождение и оригинал
    Версия источника
    entry 211; sequence 2
    SHA-256 исходника
    20b9ed0385942a0aebc3645f0f499a77e9aab0741218e2327ee80b6ae7590dca
    Обработка
    Unmodified provider response; selected fields are projected into the document.
    Сведения о версии
    Native entry and sequence versions retained.

    Посмотреть оригинал JSON · Скачать оригинал

  2. Gene Ontology Consortium / QuickGO · UniProtKB:P03004

    2026-09-09T03:20:28.660556+00:00 · CC-BY-4.0

    Происхождение и оригинал
    SHA-256 исходника
    30a929f57c0f50a1fe5ae1509981b7f62b7e077f02ef20ea6320183d3865f8ac
    Обработка
    Unmodified provider response; selected fields are projected into the document.
    Сведения о версии
    No native GO release was supplied; exact response hash and retrieval time are retained.

    Посмотреть оригинал JSON · Скачать оригинал

Посмотреть структурированные данные
Content version
f86e6ea1633c0f3c776cc043f129a234b513c50178db391c4a84c15a43801ad6
Source version
research-20260909.1
Updated
2026-09-09