← Вернуться к чтению

FLC · Q9S7Q7

Коротко

FLC — белковая запись Q9S7Q7 из UniProt для Arabidopsis thaliana (NCBI 3702). В сохранённой версии последовательность содержит 196 аминокислот. [1]

Основание утверждения

Аннотация источника

Где проверить это утверждение

uniprot-Q9S7Q7
Captured UniProt JSON: primaryAccession, organism, sequence and FUNCTION comments
Читать раздел →
Сохранить, исследовать и проверить версию

Редакционный черновик · ожидает рецензирования

Задать вопрос по этому материалу
На этой странице

Знакомство с белком

FLC участвует в регуляции времени цветения Arabidopsis thaliana. Сохранённая аннотация UniProt описывает его как предполагаемый транскрипционный фактор, который задерживает цветение, подавляя регулятор SOC1. Это помогает связать развитие целого растения с регуляцией работы генов. Здесь показан белковый продукт Q9S7Q7; ген, его транскрипт и количество белка в конкретном растении — отдельные объекты исследования.

[1]
Основание утверждения

Редакционный синтез

Где проверить это утверждение

uniprot-Q9S7Q7
Captured UniProt JSON: primaryAccession, organism, sequence and FUNCTION comments

Роль FLC рассматривается в связи с путями FRIGIDA, автономной регуляции и яровизации. В записи также приведено температурное условие отдельного исследования и ссылки, на которых основаны выводы. Эти условия нельзя автоматически переносить на любое растение или любой климат. Для разбора механизма сравните исходную аннотацию со связанным уроком о FLC, сохраняя генотип, условия опыта и версию источника.

[1]
Основание утверждения

Редакционный синтез

Где проверить это утверждение

uniprot-Q9S7Q7
Captured UniProt JSON: primaryAccession, organism, sequence and FUNCTION comments

Связать регулятор с результатом развития

Сохранённая аннотация FLC связывает предполагаемый транскрипционный фактор с подавлением SOC1 и задержкой цветения. Это регуляторная связь: белок влияет на экспрессию другого гена, а последствие для развития рассматривается на уровне растения. Урок о регуляции генов предлагает выяснить, что изменяли и что измеряли в конкретном эксперименте. Идентичность белка, количество РНК и время цветения — отдельные строки записи об эксперименте; одна не заменяет другую. Слово «предполагаемый» остаётся частью смысла сохранённой аннотации.

[1]
Основание утверждения

EcoGenesis

Где проверить это утверждение

uniprot-Q9S7Q7
Retained UniProt JSON: comments[commentType=FUNCTION], selected accession and entry version as recorded in evidence

Учебная схема

Основание утверждения

EcoGenesis

    Собственная учебная схема связи из сохранённой аннотации FUNCTION; измеренные скорость, геометрия и результат эксперимента не показаны.
    1. FLC

      Выбранный предполагаемый регулятор

    2. SOC1

      Подавляемая мишень в аннотации

    3. Время цветения

      Результат на уровне растения

    • FLC → SOC1: связан с
    • SOC1 → Время цветения: связан с

    Что известно о функции

    Функция: текст и доказательства UniProt (EN)

    Посмотреть структурированные данные
    Текст источника
    Putative transcription factor that seems to play a central role in the regulation of flowering time in the late-flowering phenotype by interacting with 'FRIGIDA', the autonomous and the vernalization flowering pathways. Inhibits flowering by repressing 'SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS 1'. At elevated temperatures (e.g. 29 degrees Celsius), maintained at high levels in a JMJ30/JMJ32-dependent manner to prevent extreme precocious flowering (PubMed:25267112)
    Язык источника
    en
    evidence codes
    • evidenceCode
      ECO:0000269
      Источник
      PubMed
      id
      10716723
    • evidenceCode
      ECO:0000269
      Источник
      PubMed
      id
      11283346
    • evidenceCode
      ECO:0000269
      Источник
      PubMed
      id
      19121105
    • evidenceCode
      ECO:0000269
      Источник
      PubMed
      id
      25267112
    [1]
    Основание утверждения

    Аннотация источника

    Где проверить это утверждение

    uniprot-Q9S7Q7
    Captured UniProt JSON: comments[commentType=FUNCTION] and attached evidence codes

    Код доказательства относится к аннотации. Запись не является измерением изображённого организма.

    Последовательность и версия

    Q9S7Q7

    Посмотреть структурированные данные
    accession
    Q9S7Q7
    name
    MADS-box protein FLOWERING LOCUS C
    length
    196
    entry version
    177
    sequence version
    1
    Последовательность
    MGRKKLEIKRIENKSSRQVTFSKRRNGLIEKARQLSVLCDASVALLVVSASGKLYSFSSG
DNLVKILDRYGKQHADDLKALDHQSKALNYGSHYELLELVDSKLVGSNVKNVSIDALVQL
EEHLETALSVTRAKKTELMLKLVENLKEKEKMLKEENQVLASQMENNHHVGAEAEMEMSP
AGQISDNLPVTLPLLN
    [1]
    Основание утверждения

    Аннотация источника

    Где проверить это утверждение

    uniprot-Q9S7Q7
    Captured UniProt JSON: sequence.value, sequence.length, sequenceVersion and entryVersion

    Гены и домены

    Связи, указанные UniProt

    Посмотреть структурированные данные
    gene symbols
    • FLC
    gene crossreferences
    • database
      GeneID
      id
      830878
      properties
      • key
        Description
        value
        -
    interpro domains
    • Источник
      interpro
      accession
      IPR050142
      name
      MADS-box/MEF2_TF
    • Источник
      interpro
      accession
      IPR033896
      name
      MEF2-like_N
    • Источник
      interpro
      accession
      IPR002487
      name
      TF_Kbox
    • Источник
      interpro
      accession
      IPR002100
      name
      TF_MADSbox
    • Источник
      interpro
      accession
      IPR036879
      name
      TF_MADSbox_sf
    [1]
    Основание утверждения

    Аннотация источника

    Где проверить это утверждение

    uniprot-Q9S7Q7
    Captured UniProt JSON: genes, features and cross-references

    Аннотации функций GO

    Выборка с кодами доказательств

    Посмотреть структурированные данные

    Показано / подготовлено / в ответе источника: 12 / 30 / 30

    GO
    GOДоказательствоПубликация или правилоКто аннотировал
    GO:0009266
    response to temperature stimulus
    Biological Process    		ECO:0000315
    acts_upstream_of_or_within    		PMID:16473970TAIR
    20060331
    GO:0009910
    negative regulation of flower development
    Biological Process    		ECO:0000315
    acts_upstream_of_or_within    		PMID:12114624TAIR
    20060331
    GO:0010048
    vernalization response
    Biological Process    		ECO:0000270
    acts_upstream_of_or_within    		PMID:15734903TAIR
    20060331
    GO:0042752
    regulation of circadian rhythm
    Biological Process    		ECO:0000315
    acts_upstream_of_or_within    		PMID:16473970TAIR
    20060331
    GO:0000976
    transcription cis-regulatory region binding
    Molecular Function    		ECO:0000353
    enables    		PMID:30356219TAIR
    20201218
    GO:0000977
    RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
    Molecular Function    		ECO:0000256
    enables    		GO_REF:0000002InterPro
    20260727
    GO:0000978
    RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
    Molecular Function    		ECO:0000318
    enables    		GO_REF:0000033GO_Central
    20220414
    GO:0000981
    DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
    Molecular Function    		ECO:0000318
    enables    		GO_REF:0000033GO_Central
    20170829
    GO:0003677
    DNA binding
    Molecular Function    		ECO:0000256
    enables    		GO_REF:0000002InterPro
    20260727
    GO:0003700
    DNA-binding transcription factor activity
    Molecular Function    		ECO:0000256
    enables    		GO_REF:0000002InterPro
    20260727
    GO:0003700
    DNA-binding transcription factor activity
    Molecular Function    		ECO:0000304
    enables    		PMID:10716723TAIR
    20050218
    GO:0003700
    DNA-binding transcription factor activity
    Molecular Function    		ECO:0000250
    enables    		PMID:11118137TAIR
    20030606
    [2]
    Основание утверждения

    Аннотация источника

    Где проверить это утверждение

    quickgo-Q9S7Q7-1
    Captured QuickGO annotation results: GO ID, qualifier, evidenceCode, reference, assignedBy and date; limited returned pages

    Это аннотации источника, а не самостоятельное доказательство причинного механизма. Полный сохранённый ответ доступен в оригиналах.

    Исследования из записи белка

    Библиографические записи

    Посмотреть структурированные данные
    • Источник
      uniprot
      id
      Q9S7Q7-citation-10072403
      title
      The FLF MADS box gene: a repressor of flowering in Arabidopsis regulated by vernalization and methylation.
      pmid
      10072403
      doi
      10.1105/tpc.11.3.445
      year
      1999
      authors
      • Sheldon C.C.
      • Burn J.E.
      • Perez P.P.
      • Metzger J.
      • Edwards J.A.
      • Peacock W.J.
      • Dennis E.S.
      journal
      Plant Cell
      Статус повторного использования
      metadata_only
      Ссылка на источник
      https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
      SHA-256 копии источника
      2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
    • Источник
      uniprot
      id
      Q9S7Q7-citation-10330478
      title
      FLOWERING LOCUS C encodes a novel MADS domain protein that acts as a repressor of flowering.
      pmid
      10330478
      doi
      10.1105/tpc.11.5.949
      year
      1999
      authors
      • Michaels S.D.
      • Amasino R.M.
      journal
      Plant Cell
      Статус повторного использования
      metadata_only
      Ссылка на источник
      https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
      SHA-256 копии источника
      2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
    • Источник
      uniprot
      id
      Q9S7Q7-citation-11130714
      title
      Sequence and analysis of chromosome 5 of the plant Arabidopsis thaliana.
      pmid
      11130714
      doi
      10.1038/35048507
      year
      2000
      authors
      • Tabata S.
      • Kaneko T.
      • Nakamura Y.
      • Kotani H.
      • Kato T.
      • Asamizu E.
      • Miyajima N.
      • Sasamoto S.
      • Kimura T.
      • Hosouchi T.
      • Kawashima K.
      • Kohara M.
      • Matsumoto M.
      • Matsuno A.
      • Muraki A.
      • Nakayama S.
      • Nakazaki N.
      • Naruo K.
      • Okumura S.
      • Shinpo S.
      • Takeuchi C.
      • Wada T.
      • Watanabe A.
      • Yamada M.
      • Yasuda M.
      • Sato S.
      • de la Bastide M.
      • Huang E.
      • Spiegel L.
      • Gnoj L.
      • O'Shaughnessy A.
      • Preston R.
      • Habermann K.
      • Murray J.
      • Johnson D.
      • Rohlfing T.
      • Nelson J.
      • Stoneking T.
      • Pepin K.
      • Spieth J.
      • Sekhon M.
      • Armstrong J.
      • Becker M.
      • Belter E.
      • Cordum H.
      • Cordes M.
      • Courtney L.
      • Courtney W.
      • Dante M.
      • Du H.
      • Edwards J.
      • Fryman J.
      • Haakensen B.
      • Lamar E.
      • Latreille P.
      • Leonard S.
      • Meyer R.
      • Mulvaney E.
      • Ozersky P.
      • Riley A.
      • Strowmatt C.
      • Wagner-McPherson C.
      • Wollam A.
      • Yoakum M.
      • Bell M.
      • Dedhia N.
      • Parnell L.
      • Shah R.
      • Rodriguez M.
      • Hoon See L.
      • Vil D.
      • Baker J.
      • Kirchoff K.
      • Toth K.
      • King L.
      • Bahret A.
      • Miller B.
      • Marra M.A.
      • Martienssen R.
      • McCombie W.R.
      • Wilson R.K.
      • Murphy G.
      • Bancroft I.
      • Volckaert G.
      • Wambutt R.
      • Duesterhoeft A.
      • Stiekema W.
      • Pohl T.
      • Entian K.-D.
      • Terryn N.
      • Hartley N.
      • Bent E.
      • Johnson S.
      • Langham S.-A.
      • McCullagh B.
      • Robben J.
      • Grymonprez B.
      • Zimmermann W.
      • Ramsperger U.
      • Wedler H.
      • Balke K.
      • Wedler E.
      • Peters S.
      • van Staveren M.
      • Dirkse W.
      • Mooijman P.
      • Klein Lankhorst R.
      • Weitzenegger T.
      • Bothe G.
      • Rose M.
      • Hauf J.
      • Berneiser S.
      • Hempel S.
      • Feldpausch M.
      • Lamberth S.
      • Villarroel R.
      • Gielen J.
      • Ardiles W.
      • Bents O.
      • Lemcke K.
      • Kolesov G.
      • Mayer K.F.X.
      • Rudd S.
      • Schoof H.
      • Schueller C.
      • Zaccaria P.
      • Mewes H.-W.
      • Bevan M.
      • Fransz P.F.
      journal
      Nature
      Статус повторного использования
      metadata_only
      Ссылка на источник
      https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
      SHA-256 копии источника
      2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
    • Источник
      uniprot
      id
      Q9S7Q7-citation-27862469
      title
      Araport11: a complete reannotation of the Arabidopsis thaliana reference genome.
      pmid
      27862469
      doi
      10.1111/tpj.13415
      year
      2017
      authors
      • Cheng C.Y.
      • Krishnakumar V.
      • Chan A.P.
      • Thibaud-Nissen F.
      • Schobel S.
      • Town C.D.
      journal
      Plant J.
      Статус повторного использования
      metadata_only
      Ссылка на источник
      https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
      SHA-256 копии источника
      2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
    • Источник
      uniprot
      id
      Q9S7Q7-citation-CI-CI4AM1G71UC0S
      title
      Community-consensus reference genome of Arabidopsis thaliana Col-0.
      pmid
      —
      doi
      —
      year
      FEB-
      authors
        journal
        —
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-10716723
        title
        The molecular basis of vernalization: the central role of FLOWERING LOCUS C (FLC).
        pmid
        10716723
        doi
        10.1073/pnas.97.7.3753
        year
        2000
        authors
        • Sheldon C.C.
        • Rouse D.T.
        • Finnegan E.J.
        • Peacock W.J.
        • Dennis E.S.
        journal
        Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-11283346
        title
        Loss of flowering locus c activity eliminates the late-flowering phenotype of frigida and autonomous pathway mutations but not responsiveness to vernalization.
        pmid
        11283346
        doi
        10.1105/tpc.13.4.935
        year
        2001
        authors
        • Michaels S.D.
        • Amasino R.M.
        journal
        Plant Cell
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-14593187
        title
        Regulation of flowering time by histone acetylation in Arabidopsis.
        pmid
        14593187
        doi
        10.1126/science.1091109
        year
        2003
        authors
        • He Y.
        • Michaels S.D.
        • Amasino R.M.
        journal
        Science
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-14712276
        title
        Vernalization in Arabidopsis thaliana is mediated by the PHD finger protein VIN3.
        pmid
        14712276
        doi
        10.1038/nature02195
        year
        2004
        authors
        • Sung S.
        • Amasino R.M.
        journal
        Nature
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-16299497
        title
        Prevention of early flowering by expression of FLOWERING LOCUS C requires methylation of histone H3 K36.
        pmid
        16299497
        doi
        10.1038/ncb1329
        year
        2005
        authors
        • Zhao Z.
        • Yu Y.
        • Meyer D.
        • Wu C.
        • Shen W.-H.
        journal
        Nat. Cell Biol.
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-15659097
        title
        HUA2 is required for the expression of floral repressors in Arabidopsis thaliana.
        pmid
        15659097
        doi
        10.1111/j.1365-313x.2004.02300.x
        year
        2005
        authors
        • Doyle M.R.
        • Bizzell C.M.
        • Keller M.R.
        • Michaels S.D.
        • Song J.
        • Noh Y.-S.
        • Amasino R.M.
        journal
        Plant J.
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      • Источник
        uniprot
        id
        Q9S7Q7-citation-17996704
        title
        The Arabidopsis RNA-binding protein FCA requires a lysine-specific demethylase 1 homolog to downregulate FLC.
        pmid
        17996704
        doi
        10.1016/j.molcel.2007.10.018
        year
        2007
        authors
        • Liu F.
        • Quesada V.
        • Crevillen P.
        • Baeurle I.
        • Swiezewski S.
        • Dean C.
        journal
        Mol. Cell
        Статус повторного использования
        metadata_only
        Ссылка на источник
        https://rest.uniprot.org/uniprotkb/Q9S7Q7.json
        SHA-256 копии источника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
      [1]
      Основание утверждения

      Аннотация источника

      Где проверить это утверждение

      uniprot-Q9S7Q7
      Captured UniProt JSON: references and citation cross-references

      Показаны метаданные. Право на текст статьи определяется отдельно.

      Как читать эти данные

      Организм записи UniProt

      Arabidopsis thaliana · NCBI 3702Научный профиль →

      Ваш исследовательский вопрос

      Сохраните статью, чтобы вернуться к вопросу и этой версии источников.

      Продумать проверку

      Это ваш план исследования. Заполнение полей не подтверждает гипотезу.

      Задать вопрос по этому материалу

      Источники и версии

      Редакционный черновик · ожидает рецензирования

      1. UniProt Consortium · Q9S7Q7

        2026-09-09T03:19:39.769546+00:00 · CC-BY-4.0

        Происхождение и оригинал
        Версия источника
        entry 177; sequence 1
        SHA-256 исходника
        2159cce16879e4d5f2b04e2fda6b73b07f5d70e9257555babf2bc9ee7f701aac
        Обработка
        Unmodified provider response; selected fields are projected into the document.
        Сведения о версии
        Native entry and sequence versions retained.

        Посмотреть оригинал JSON · Скачать оригинал

      2. Gene Ontology Consortium / QuickGO · UniProtKB:Q9S7Q7

        2026-09-09T03:19:40.604412+00:00 · CC-BY-4.0

        Происхождение и оригинал
        SHA-256 исходника
        1bce19d629054daf9bef55482bbda7cd9c4aa6574d0cff5042e009bcd053d026
        Обработка
        Unmodified provider response; selected fields are projected into the document.
        Сведения о версии
        No native GO release was supplied; exact response hash and retrieval time are retained.

        Посмотреть оригинал JSON · Скачать оригинал

      Посмотреть структурированные данные
      Версия содержания
      85abe6afdb66c867ab7cee18a60f9cebe80088df08a31991669b35df0a35d9cc
      Версия источника
      research-20260909.1
      Обновлено
      2026-10-01